Thèse Développement de Modèles 3D Multicellulaires pour Explorer la Résistance aux Traitements Anticancéreux et l'Impact des Polluants Environnementaux H/F - 33

Établissement : Université de Bordeaux
École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé
Laboratoire de recherche : BoRdeaux Institute of onCology
Direction de la thèse : A. Majid KHATIB
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59

Ce projet a pour but de développer des modèles 3D innovants et biologiquement pertinents pour étudier la résistance aux traitements anticancéreux, en reproduisant le plus proche possible les interactions complexes entre les cellules tumorales et leur microenvironnement. Ces modèles intégreront des co-cultures multicellulaires impliquant des fibroblastes activés (CAF), des macrophages, des lymphocytes T, et des cellules endothéliales, afin de recréer les interactions clés modulant la réponse tumorale aux traitements. L'objectif principal est d'évaluer l'efficacité de diverses combinaisons thérapeutiques, incluant chimiothérapies, immunothérapies, et inhibiteurs moléculaires ciblés, tout en décryptant les mécanismes responsables de la résistance.
Par ailleurs, le projet s'intéresse à l'impact des polluants environnementaux, tels que les perturbateurs endocriniens, sur ces mécanismes de résistance. Leurs effets seront analysés pour comprendre leur rôle dans l'altération des réponses aux thérapies anticancéreuses. Pour ce faire, des approches avancées, telles que la transcriptomique, la protéomique, et des analyses fonctionnelles, seront mises en oeuvre afin d'identifier les voies moléculaires impliquées et de proposer des stratégies novatrices pour contrer ces résistances.
Ce projet sera mené en étroite collaboration avec des cliniciens et des oncologues de l'équipe afin d'assurer la pertinence clinique des résultats obtenus et de faciliter d'éventuelles traductions des découvertes vers des applications cliniques concrètes. En définitive, le projet vise à fournir des outils avancés pour optimiser les traitements personnalisés et explorer les effets délétères de la pollution environnementale sur la progression tumorale et la réponse thérapeutique, contribuant ainsi à de potentielles avancées en oncologie et en santé environnementale.

Ce projet vise à développer des modèles 3D avancés pour étudier la résistance aux traitements anticancéreux en reproduisant les interactions complexes entre les cellules tumorales et leur microenvironnement. Il évalue l'efficacité de combinaisons thérapeutiques tout en analysant les mécanismes de résistance. En outre, il examine l'impact des polluants environnementaux, comme les perturbateurs endocriniens, sur ces mécanismes.

L'objectif est de proposer des stratégies innovantes pour surmonter ces résistances, en collaboration avec des cliniciens et des oncologues, afin d'améliorer les traitements personnalisés et comprendre l'impact de la pollution sur la progression tumorale.

Les technologies utilisées dans ce projet incluent :
Modèles 3D multicellulaires : Sphéroïdes tumoraux et organoïdes pour simuler les interactions complexes entre les cellules tumorales et leur microenvironnement.
Co-cultures multicellulaires : Intégration de fibroblastes activés (CAF), macrophages, lymphocytes Tet cellules endothéliales pour reproduire les réponses immunitaires et tumorales.
Approches transcriptomiques et protéomiques : Séquencement de l'ARN (RNA-Seq), analyse protéomique par spectrométrie de masse pour identifier les voies moléculaires impliquées dans la résistance aux traitements.
Analyses fonctionnelles : Tests de viabilité cellulaire, prolifération, et activation de marqueurs spécifiques pour évaluer les réponses aux traitements.
Modèles précliniques : Souris transgéniques et modèles de poissons zèbres pour valider l'efficacité des petites molécules et des combinaisons thérapeutiques.
Flow cytometry : Pour analyser les populations cellulaires, l'activation, et les marqueurs d'épuisement des cellules T. lmmunohistochimie et imagerie confocale : Pour étudier l'architecture tumorale et l'interaction cellulaire dans les modèles 3D et précliniques.