Thèse Etude Transversale des Mécanismes Neurodégénératifs Impliqués dans les Protéinopathies H/F - 33

Établissement : Université de Bordeaux
École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé
Laboratoire de recherche : Institut des Maladies Neurodégénératives
Direction de la thèse : Benjamin DEHAY ORCID 0000000317239045
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59

Les mécanismes cellulaires impliqués dans la neurodégénérescence et la synucléinopathie sont multiples dans ces pathologies. Nous avons déjà démontré l'implication des lysosomes et d'un stress lysosomal dans la pathologie. L'idée est d'évaluer la présence ou non d'une communication entre le lysosome et le réticulum endoplasmique, directement par des sites de contact membranaires ou indirectement, dans des conditions physiologiques afin de comprendre la régulation métabolique et fonctionnelle fine existante entre ces deux organelles. Ensuite, nous chercherons à déterminer comment cette intercommunication est altérée dans les conditions pathologiques des synucléinopathies expliquant la présence du stress lysosomal et du réticulum endoplasmique dans ces maladies.

In this regard, the research program will be organized in parallel research programs to achieve the same aim: Identify the molecular crosstalk between the two organelles, ER and lysosome, in physiological and pathophysiological conditions in eukaryotic cells.

Les maladies neurodégénératives représentent un des plus grands défis pour la recherche fondamentale et la médecine en raison de leur
prévalence, de leur coût, et de l'absence de traitements neuroprotecteurs efficaces.

Using a combination of technologies, this project, conducted first in vitro will allow to unravel under physiological and different pathophysiological conditions, defined as (i) in the context of the cell handling lysosomal stress through different pharmacological triggers and pathological context; (ii) in the context of the cell handling ER stress through different well-characterized triggers and pathological context. Further cell biology assays will be followed to unmask the inter-organellar membrane domains over-time using live cell-imaging, the well-established regulators of both organelles (i.e. calcium and cholesterol) measured by imaging technique as well as their signaling pathways. ER parameters will be measured through UPR PCR array, to get an overview on the different pathways activated by this adaptive response (Regulation of Cholesterol Metabolism, ER Protein Folding Quality Control, ERAD...). In parallel, this transcriptional analysis will be associated with well-characterized ER stress-related assays, and functional analysis of the lysosome will be performed concomitantly to distinguish the drug effects on both organelles.