Thèse Cohésine Adaptation Cellulaire et Dynamique du Génome une Étude Intégrée chez S. Pombe H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Bordeaux École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé Laboratoire de recherche : Institut de Biochimie et Génétique Cellulaires Direction de la thèse : Adrien BIROT ORCID 0000000282998518 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59 L'objectif de ce projet de recherche est d'explorer les mécanismes d'adaptation cellulaire aux changements environnementaux chez la levure Schizosaccharomyces pombe. Nous faisons l'hypothèse que la réponse adaptative rapide passe en partie par des modifications post-traductionnelles (PTM) de Cohésine, un complexe essentiel à la structuration de la chromatine. Ces PTM pourraient remodeler l'architecture chromatinienne en modulant la dynamique et les fonctions de Cohésine, permettant ainsi à la cellule d'ajuster son programme transcriptionnel face aux stress.
Le projet s'articule autour d'une thèse de trois ans centrée sur :
1. L'identification systématique des PTM induites par divers stress environnementaux (stress oxydant, osmotique, thermique...).
2. La caractérisation fonctionnelle de ces modifications sur Cohésine et sur l'organisation globale de la chromatine.
3. L'étude de leurs conséquences sur la survie cellulaire et l'expression génique.
À terme, ce travail vise à fournir une compréhension approfondie des mécanismes épigénétiques et structuraux permettant aux cellules d'orchestrer une adaptation rapide au stress, et à établir une plateforme collaborative durable pour l'étude fonctionnelle des PTM. Le complexe cohésine est un ensemble protéique capable d'interagir avec l'ADN. Grâce à ses différents modes de capture de l'ADN, ainsi qu'à la phase du cycle cellulaire durant laquelle cette interaction a lieu, cohésine assure diverses fonctions essentielles au destin cellulaire.

Notre objectif est de comprendre comment cohésine peut intégrer un ensemble de signaux afin de moduler et de réguler l'architecture nucléaire. Un ensemble de données expérimentales issues du laboratoire suggère l'existence d'un nouveau rôle de cohésine dans la réponse au stress cellulaire. Le projet de thèse visera à étayer et caractériser ce lien. 1. The systematic identification of PTMs induced by various environmental stresses (oxidative, osmotic, thermal, etc.).
2. The functional characterisation of these modifications on Cohesin and on the overall organisation of chromatin.
3. The study of their consequences on cell survival and gene expression. Genetic, Chip-qPCR and ChIP-seq, Hi-C, Mass spectrometry, general molecular cloning tools (CRISPR-cas9 in fission yeast).

Maitrise de la génétique mendélienne et des techniques de biologie moléculaire.
Connaissances théoriques des technologies de ChIP, Hi-C et de spectrométrie de masse.
Connaissances théoriques du modèle d'étude S.pombe.
Intérêt pour les analyses larges échelles (genomique et protéomique)