Thèse Étude du Rôle des Dnases Extracellulaires dans les Réponses Immunitaires Anti-Tumorales et aux Thérapies Anti-Cancéreuses H/F - 33

Établissement : Université de Bordeaux
École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé
Laboratoire de recherche : Immunologie Conceptuelle, Expérimentale et Translationnelle
Direction de la thèse : Dorothée DULUC ORCID 0000000272529072
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59

L'ADN dérivé des tumeurs est un médiateur clé des réponses immunitaires antitumorales, notamment par sa capacité à activer les cellules dendritiques (CD) via des voies de détection de l'ADN telles que TLR9 et cGAS, conduisant à la production d'interférons de type I et à l'activation subséquente des lymphocytes T cytotoxiques (CTL). Les thérapies cytotoxiques, incluant la chimiothérapie et la radiothérapie, peuvent amplifier ces réponses en favorisant la mort cellulaire immunogène et en augmentant la disponibilité de l'ADN d'origine tumorale. Si la détection de l'ADN tumoral peut promouvoir l'immunité antitumorale, une activation prolongée ou dysrégulée de ces voies peut également contribuer à l'immunosuppression au sein du microenvironnement tumoral, notamment par le recrutement de populations immunitaires suppressives et la mise en place de mécanismes d'échappement immunitaire. Ainsi, la régulation de la disponibilité et de l'immunogénicité de l'ADN tumoral apparaît comme un aspect critique mais encore insuffisamment compris de l'immunité antitumorale.
À l'état basal, les DNases extracellulaires jouent un rôle essentiel dans le contrôle des niveaux d'ADN du soi et dans la prévention d'une activation immunitaire inappropriée. DNASE1L3 est une DNase extracellulaire produite principalement par les cellules dendritiques et les macrophages, et connue pour participer à l'élimination de l'ADN libéré par les cellules en cours de mort. Des résultats récents, incluant des observations issues de notre groupe, suggèrent que DNASE1L3 pourrait être nécessaire à des réponses optimales aux traitements anticancéreux cytotoxiques aux immunothérapies.
L'objectif de ce projet de thèse est d'élucider les mécanismes par lesquels DNASE1L3 module les réponses immunitaires antitumorales au cours de la chimiothérapie, de la radiothérapie et de l'immunothérapie, et d'évaluer sa pertinence dans les cancers humains. Le projet visera à déterminer comment DNASE1L3 influence la reconnaissance de l'ADN par les cellules immunitaires et, par conséquent, leur activation au sein du microenvironnement tumoral, ainsi que son impact sur les mécanismes immunosuppresseurs. En parallèle, la régulation de l'expression et de l'activité de DNASE1L3 en réponse aux signaux dérivés de la tumeur et aux traitements anticancéreux sera étudiée dans des modèles expérimentaux ainsi que dans des cellules immunitaires humaines. Enfin, le projet évaluera l'activité de DNASE1L3 dans des échantillons cliniques afin de déterminer si ce paramètre pourrait constituer un biomarqueur associé à la réponse aux traitements.

L'ADN extracellulaire endogène, issu soit des tumeurs, soit des neutrophiles infiltrant les tumeurs, joue un rôle central dans la modulation des réponses immunitaires anti-tumorales. Selon le contexte, cet ADN peut soit stimuler des réponses immunitaires contre les tumeurs, soit favoriser une tolérance immunitaire, permettant ainsi aux tumeurs d'échapper aux attaques du système immunitaire. Bien que les DNases extracellulaires soient essentielles pour contrôler la quantité et la qualité de cet ADN, leur rôle dans la régulation de l'immunité anti-tumorale n'est pas encore élucidé. Nos recherches se sont concentrées sur le rôle de DNASE1L3, une DNase clé responsable de la digestion de l'ADN des cellules mourantes dans le contexte tumoral.

It is now clear that endogenous extracellular DNA, derived either from tumors or tumor-infiltrating neutrophils, plays a pivotal role in shaping anti-tumor immune responses. Depending on the context, this DNA can either stimulate immune responses against tumors or foster immune tolerance, allowing tumors to evade immune attacks. While extracellular DNASEs are critical in controlling the quantity and quality of this DNA, their role in regulating anti-tumor immunity is only beginning to be recognized. Our research has focused on the role of DNASE1L3, a key DNASE responsible for digesting DNA from dying cells in the tumor context.

Ce projet de thèse repose sur des études réalisées in vivo, ex vivo et in vitro utilisant des modèles murins, des lignées cellulaires tumorales de cancer, des cellules immunitaires humaines primaires isolées de donneurs sains et des échantillons de plasma provenant de banques de patients. Le(a) candidat(e) en thèse effectuera donc de multiples expérimentations incluant des expériences in vivo de suivi tumoral, de la culture cellulaire, purification cellulaire des cellules immunitaires. L'activation de cellules immunitaires sera mesurée par leur production de cytokines inflammatoires par les techniques d'ELISA, par l'expression de molécules de surface par cytométrie et par l'expression d'ARNm évaluée par RT-PCR quantitative ou RNAseq. En parallèle, l'activité de la DNASE1L3 produite par ces cellules dendritiques sera mesurée par la capacité à digérer l'ADN nu ou l'ADN nucléaire par électrophorèse. L'ensemble des expériences décrites ci-dessus sera réalisé sur des cellules immunitaires primaires humaines ou murines.
This thesis project is based on studies conducted in vivo, ex vivo, and in vitro using murine models, tumor cell lines, primary human immune cells isolated from healthy donors, and plasma samples from patient biobanks. The Ph.D. candidate will perform a wide range of experiments, including in vivo tumor monitoring, cell culture, immune cell purification (including DCs and T lymphocytes), and their activation by various stimuli. Immune cell activation will be assessed through the production of inflammatory cytokines using ELISA, surface molecule expression by flow cytometry, and mRNA expression evaluated by quantitative RT-PCR or RNA sequencing. Additionally, the activity of DNASE1L3 produced by these dendritic cells will be measured by its capacity to digest free or nuclear DNA via electrophoresis. All the aforementioned experiments will be conducted on primary human or murine immune cells.