Thèse Etude de la Formation des Invadosomes Induits par le Stress Génotoxique Vers de Nouvelles Cibles Anti-Métastases H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Bordeaux École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé Laboratoire de recherche : BoRdeaux Institute of onCology Direction de la thèse : Armelle MENARD ORCID 0000000255752539 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59 Nous avons découvert que des bactéries du microbiote productrices de génotoxines, comme la CDT et la colibactine, ciblent le cytosquelette cellulaire pour induire la formation d'invadosomes chez les cellules cancéreuses. Ces structures dégradent la matrice extracellulaire et sont cruciales pour l'invasion et la métastase. La formation d'invadosomes est liée aux dommages à l'ADN induits par ces toxines et des agents de dommages spécifiques à l'ADN comme les irradiations, la streptozocine, l'étoposide, ou encore les composants du GEMOX (gemcitabine et oxaliplatine), une chimiothérapie utilisée dans le traitement des cancers des voies biliaires. Les dommages à l'ADN déclencheraient la formation d'invadosomes, favorisant la métastase.

L'objectif est de définir les mécanismes moléculaires de la formation des invadosomes en réponse au stress génotoxique et d'évaluer leur rôle dans la métastase.

Nous caractériserons les invadosomes avec une double approche in vitro et in vivo.
- In vitro - Nous étudierons certaines protéines du cytosquelette cellulaire importantes dans la formation des invadosomes. Une analyse protéomique et/ou phosphoprotéomique des invadosomes, isolés par microdissection laser, identifiera les protéines et les voies de signalisation impliquées.
- In vivo - La présence d'invadosomes sera évaluée dans des tumeurs de patients. La dissémination des cellules cancéreuses exposées au stress génotoxique sera étudiée à l'aide de différents modèles animaux (souris et/ou zebrafish).
Ce projet montrera que les dommages à l'ADN induits par les génotoxines de notre microbiote et certains traitements anti-cancéreux favorisent la métastase via la formation d'invadosomes. Version française plus bas.

We will investigate the role of DNA damage induced by chemotherapeutic agents and bacterial genotoxins (CDT and colibactin) in digestive carcinogenesis, specifically focusing on metastasis. Globally, digestive cancers are highly prevalent, accounting for one in four cancer cases (4.8 million cases) and one in three deaths (3.4 million deaths) in 2018. This project aims to demonstrate that DNA damage-whether induced by bacterial genotoxins or chemo-radiotherapy-triggers a remodeling of the cellular microenvironment, thereby exacerbating cancer progression by promoting metastasis. This study is critical in the fight against cancer and the emergence of treatment resistance.

Note : The Cytolethal Distending Toxin (CDT) and colibactin are genotoxins produced by specific bacteria within the gut microbiota. By inducing DNA damage, these toxins act as predisposing factors for cancer development, particularly digestive malignancies such as colorectal cancer, the incidence of which has doubled over the last 20 years in young adults (under 40). The etiology of certain cancers may stem from chronic or repeated exposure to colibactin- or CDT-producing bacteria beginning in childhood.

Nous étudierons le rôle des dommages à l'ADN induits par des agents de chimiothérapies et génotoxines bactériennes (CDT et colibactine) dans carcinogenèse digestive et notamment la métastase.
À l'échelle mondiale, les cancers digestifs sont très répandus, représentant, en 2018, un cas de cancer sur quatre (4,8 millions de cas) et un décès sur trois (3,4 millions de décès). Ce projet montrera que les dommages à l'ADN, qu'ils soient induits par les génotoxines bactériennes ou des traitement chimio et radio thérapeutiques, induisent le remodelage du microenvironnement cellulaire et aggravent le cancer en induisant la métastase. Cette étude est importante dans la lutte contre le cancer et la résistance aux traitements chimio et radio thérapeutiques.

NB. La génotoxine Cytolethal Distending Toxin (CDT) et la colibactine sont des toxines produites par certaines bactéries de notre microbiote. En endommagent l'ADN de nos cellules, ces toxines constituent un facteur prédisposant au développement de cancers, notamment de cancers digestifs comme le cancer colorectal dont l'incidence a doublé au cours des 20 dernières années chez les jeunes (
This thesis aims to elucidate the influence of genotoxic agents-whether of therapeutic origin (e.g., chemotherapies) or bacterial-on digestive carcinogenesis, with a particular focus on the mechanisms underlying metastatic progression.

Cette thèse vise à élucider l'influence des agents génotoxiques - qu'ils soient d'origine thérapeutique (chimiothérapies) ou bactérienne - sur la carcinogenèse digestive, avec une attention particulière portée aux mécanismes de progression métastatique. Version française plus bas.

We will employ both in vitro and in vivo approaches.

In vitro - We will study specific cellular cytoskeleton proteins essential to invadosome formation. A proteomic and/or phosphoproteomic analysis of invadosomes, isolated via laser microdissection, will identify the proteins (mass spectrometry, OncoProt platform, University of Bordeaux), kinases, and signaling pathways involved.

In vivo - The presence of invadosomes will be evaluated in patient tumors. The dissemination of cancer cells exposed to genotoxic stress will be studied using various animal models (mice and/or zebrafish; Vivoptic and Xenofish platforms, BRIC, University of Bordeaux). This project will demonstrate that DNA damage induced by microbiota-derived genotoxins and certain anti-cancer treatments promotes metastasis through invadosome formation.

Nous utiliserons des approches in vitro et in vivo.

- In vitro - Nous étudierons certaines protéines du cytosquelette cellulaire importantes dans la formation des invadosomes. Une analyse protéomique et/ou phosphoprotéomique des invadosomes, isolés par microdissection laser, identifiera les protéines (spectrométrie de masse, plateforme OncoProt Université de Bordeaux), kinases et les voies de signalisation impliquées.

- In vivo - La présence d'invadosomes sera évaluée dans des tumeurs de patients. La dissémination des cellules cancéreuses exposées au stress génotoxique sera étudiée à l'aide de différents modèles animaux (souris et/ou poisson zèbre ; plateformes Vivoptic et Xenofish, BRIC, Université de Bordeaux).
Ce projet montrera que les dommages à l'ADN induits par les génotoxines de notre microbiote et certains traitements anti-cancéreux favorisent la métastase via la formation d'invadosomes.

L'étudiant(e) devra être motivé(e) par ce projet à la frontière de différentes disciplines comme la signalisation cellulaire et le cancer.
De bonnes connaissances en signalisation cellulaire seraient appréciées.
Un bon niveau d'anglais est exigé sauf si l'étudiant parle Français.