Thèse Comprendre la Formation d'Occlusions des Vaisseaux du Xylème en Réponse à des Blessures chez la Vigne H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Bordeaux École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé Laboratoire de recherche : Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne Direction de la thèse : Sarah COOKSON ORCID 000000032591192X Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59 Les plantes sont fréquemment blessées au cours de leur vie et ont développé toute une série de stratégies pour protéger leurs tissus contre l'invasion d'agents pathogènes et la déshydratation. Au cours des premières secondes ou minutes, le phloème est bloqué par des protéines P, puis, dans les minutes ou les heures qui suivent, de la callose se dépose au niveau des pores de la plaque criblée pour former une barrière plus durable. Les vaisseaux du xylème sont obstrués, soit par des tyloses (petites excroissances cellulaires), soit par des gels, mais plus lentement, sur une période de plusieurs jours à plusieurs semaines. En plus de fermer les tissus vasculaires, des molécules protectrices telles que les polyphénols s'accumulent également dans les tissus au cours des premiers jours suivant la blessure.
Les pratiques viticoles induisent des blessures répétées pendant le cycle de la vigne, en particulier en hiver, lorsque les pousses de l'année précédente sont éliminées. On sait que les vignes obstruent les vaisseaux du xylème avec des gels ou des tyloses (Sun et al., 2006, 2008). Bien que la formation d'occlusions des vaisseaux du xylème ait été étudiée chez la vigne, on sait peu de choses sur les différences de réponse entre les différents génotypes, la composition chimique de ces occlusions ou les gènes impliqués dans leur formation. L'objectif de cette étude est de caractériser la variation génétique dans la formation d'occlusions des vaisseaux du xylème chez des génotypes de vigne taillés à différents moments, d'analyser la composition de ces occlusions à l'aide de la microscopie Raman et d'identifier les gènes potentiellement impliqués dans la formation de différents types d'occlusions par séquençage d'ARN. Le rôle des gènes candidats impliqués dans la formation d'occlusions des vaisseaux du xylème sera testé expérimentalement à l'aide de la technique d'extinction génique induite par un virus.

The student will join an ongoing project so that some preliminary data will be available to the student and most of the techniques used in the project have already been optimized The objectives of this Ph.D. thesis are:
1) To characterize the extent and speed of xylem vessel occlusion formation in response to wounding in different grapevine genotypes and at different times of the year
2) To determine the composition of xylem vessel occlusions formed in different genotypes and at different times of the year
3) To identify the genes differentially expressed in the xylem parenchyma during occlusion formation in different genotypes and at different dates.
4) To determine the role of candidate genes in xylem vessel occlusion using viral induced gene silencing.
The student will learn the techniques of RNA extraction, analysis of RNA sequencing data, light and RAMAN microscopy, grapevine pruning, general statistical and image analysis. He/she will gain knowledge of pruning, xylem vessels, cell wall and grapevine physiology.

Les candidats doivent être fortement intéressés par la physiologie des plantes.