Thèse Impact du Microenvironnement Tissulaire sur la Reprogrammation Métabolique des Ilc2 Pendant la Fibrose. H/F - 33

Établissement : Université de Bordeaux
École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé
Laboratoire de recherche : Immunologie Conceptuelle, Expérimentale et Translationnelle
Direction de la thèse : Paôline LAURENT ORCID 0000000171022184
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59

La fibrose est un déterminant majeur de la défaillance d'organes dans la sclérodermie systémique (SSc) ainsi que dans de nombreuses maladies chroniques. Elle résulte d'interactions complexes entre cellules immunitaires et cellules stromales au sein des tissus, dont les mécanismes restent encore partiellement compris. Parmi les acteurs immunitaires impliqués, les cellules lymphoïdes innées de type 2 (ILC2) ont récemment émergé comme des médiateurs importants de la fibrose, notamment en raison de leur localisation tissulaire et de leur capacité à répondre aux signaux du microenvironnement. Si le rôle des ILC2 dans les processus fibrosants commence à être mieux décrit, les mécanismes qui régulent leurs fonctions au niveau cellulaire restent largement inexplorés. En particulier, la façon dont leur métabolisme s'adapte aux contraintes du tissu fibrosé et influence leur activité profibrosante demeure inconnue. Pourtant, l'adaptation métabolique est aujourd'hui reconnue comme un élément clé de l'activation et de la plasticité des cellules immunitaires.
Ce projet de doctorat vise à comprendre comment le microenvironnement tissulaire module le métabolisme des ILC2 et à déterminer l'impact de cette reprogrammation sur leur contribution à la fibrose cutanée et systémique dans la SSc. En s'appuyant sur des résultats préliminaires solides, ce travail combinera des approches complémentaires incluant l'analyse de cellules issues de patients, des systèmes de co-culture avec des cellules stromales, des modèles ex vivo et des modèles murins pertinents de fibrose.
Dans un premier temps, les caractéristiques métaboliques des ILC2 seront étudiées dans des contextes fibrosés et non fibrosés. Nous analyserons ensuite comment les interactions avec les cellules stromales influencent ces programmes métaboliques et les fonctions des ILC2. Enfin, des approches fonctionnelles permettront d'établir le lien entre adaptation métabolique des ILC2 et progression de la fibrose.
En explorant les interactions métaboliques entre cellules immunitaires et microenvironnement tissulaire, ce projet ambitionne d'ouvrir de nouvelles perspectives pour la compréhension des mécanismes de la fibrose et l'identification de cibles thérapeutiques innovantes dans la sclérodermie systémique et d'autres maladies fibrosantes. Il offrira également un cadre de formation stimulant pour un jeune chercheur au sein d'un environnement de recherche dynamique.

La fibrose est un déterminant majeur de la défaillance d'organes dans la sclérodermie systémique et de nombreuses maladies chroniques. Elle résulte d'interactions complexes entre cellules immunitaires et cellules stromales au sein des tissus, dont les mécanismes restent encore partiellement compris. Parmi les cellules immunitaires impliquées, les cellules lymphoïdes innées de type 2 (ILC2) ont récemment émergé comme des acteurs importants de la fibrose, notamment en raison de leur caractère résidant tissulaire et de leur capacité à intégrer des signaux issus du microenvironnement local. Si le rôle des ILC2 dans les processus fibrosants commence à être mieux décrit, les mécanismes intracellulaires qui régulent leurs fonctions restent largement inexplorés. En particulier, la manière dont leur métabolisme s'adapte aux contraintes du tissu fibrosé et conditionne leur activité profibrosante demeure inconnue. Pourtant, l'adaptation métabolique est aujourd'hui reconnue comme un élément clé de l'activation et de la plasticité des cellules immunitaires, suggérant un rôle central dans la régulation des fonctions des ILC2 au cours de la fibrose.

L'objectif principal de ce projet de doctorat est de caractériser l'impact du microenvironnement fibrosé sur le métabolisme des ILC2 et de déterminer comment cette adaptation métabolique influence leurs fonctions profibrosantes dans la sclérodermie systémique. Le projet vise à identifier les mécanismes cellulaires par lesquels les interactions avec les cellules stromales et immunitaires modulent l'activation et la plasticité des ILC2, et à évaluer la pertinence de ces mécanismes dans des contextes expérimentaux et translationnels.

Ce projet de thèse repose sur des approches complémentaires in vivo, ex vivo et in vitro, combinant l'étude de cellules issues de patients atteints de sclérodermie systémique, des systèmes de co-culture avec des cellules stromales (fibroblastes, cellules endothéliales, macrophages), ainsi que des modèles murins pertinents de fibrose cutanée et systémique. Le(a) doctorant(e) réalisera des expériences de culture cellulaire, de purification et d'analyse de populations immunitaires rares, notamment les ILC2, ainsi que des études fonctionnelles visant à évaluer leur activation et leurs propriétés profibrosantes. Les analyses incluront l'évaluation de l'état d'activation des ILC2, l'étude de leurs programmes métaboliques et l'analyse de l'expression génique associée, à l'aide d'approches moléculaires et cytométriques adaptées. Des approches fonctionnelles permettront d'examiner le lien entre métabolisme des ILC2, interactions avec le microenvironnement et progression de la fibrose dans des systèmes expérimentaux contrôlés.