Thèse Ciblage de la Réponse au Stress Intégré de la Cellule pour le Traitement des Immunodéficiences Acquises et le Cancer H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Bordeaux École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé Laboratoire de recherche : Microbiologie fondamentale et Pathogénicité Direction de la thèse : Mathieu METIFIOT ORCID 0000000281039120 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59 Le laboratoire étudie les mécanismes de réplication des pathogènes humains et animaux dans le but de développer de nouvelles stratégies thérapeutiques. Notre équipe s'intéresse plus particulièrement aux virus ARN tel le VIH, le SARS-CoV-2 et le ZIKV. Nous cherchons par conséquent à mieux comprendre les interactions moléculaires prenant place dans la cellule au cours de l'infection. GCN2 est une protéine cellulaire clé dans la réponse au stress avec un rôle déterminant dans de multiples affections humaines comme le cancer et les maladies neurodégénératives (e.g. Alzheimer). Nous avons récemment montré que GCN2 a également un rôle dans l'immunité innée, agissant comme facteur de restriction aux infections par le VIH et autres rétrovirus animaux. Les travaux de thèse pourront donc s'orienter dans les thématiques de recherche de l'équipe qui incluent:
- L'étude et la compréhension des interactions protéines-protéines impliquant les protéines de l'ISR dont GCN2 avec les facteurs viraux.
- Caractériser le rôle cellulaire de GCN2 au cours de l'infection par différents virus ARN dont le VIH et autres lentivirus.
- Utiliser les données recueillies au laboratoire pour développer de nouvelles stratégies antivirales, de thérapie génique et/ou anticancer. Nous avons identifié des facteurs cellulaires capables de restreindre la réplication virale de plusieurs virus ARN pathogènes pour l'homme. Pour comprendre leur mécanisme d'action, nous avons mis en place des modèles cellulaires d'étude de la réplication de ces virus ainsi que des approches biochimiques d'étude des enzymes virales impliquées dans cette réplication. Comprendre la régulation de la réplication virale et les mécanismes de contrôle de l'infection par la cellule. Identifier les moyens mis en
place par le virus pour contourner ces moyens de défense cellulaire. Le candidat sera amené à purifier des protéines recombinantes (virales et humaines), faire de la culture de cellules de mammifères, de la transduction/infection de ces cellules (vecteurs non réplicatifs et virus réplicatifs, modification par CRISPR-cas9), de la microscopie confocale, du séquençage à haut-débit (nanopore), des dosages par PCR quantitatives, des tests d'activités enzymatiques in vitro et développer des essais basés sur la technologie AlphaScreen.

Bon niveau de connaissances en biochimie, biologie moléculaire et cellulaire.
Esprit d'équipe.