Thèse Thérapie Génique de l'Environnement Tumoral pour Forcer l'Entrée et la Destruction Immunitaire des Tumeurs Pancréatiques H/F - 33

Établissement : Université de Bordeaux
École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé
Laboratoire de recherche : BoRdeaux Institute of onCology
Direction de la thèse : Sandrine DABERNAT ORCID 0000000183729945
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59

L'adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC) présente un pronostic particulièrement sombre et des options thérapeutiques efficaces limitées. Les immunothérapies, pourtant prometteuses dans d'autres cancers, se sont révélées inefficaces dans le PDAC. Les cellules CAR-T (Chimeric Antigen Receptor T cells) apparaissent comme les cellules immunitaires les plus puissantes en termes d'activité antitumorale. Toutefois, leur application au PDAC est décevante en raison d'un microenvironnement tumoral inaccessible et fortement immunosuppresseur. Ainsi, le développement de stratégies permettant de lever l'immunosuppression tumorale représente une progression majeure pour améliorer le contrôle tumoral.
Contrairement aux nombreuses approches visant à améliorer directement les CAR-T cells, nous proposons une thérapie génique basée sur des lentivirus oncotropes afin de créer une brèche dans le microenvironnement tumoral et d'attirer des lymphocytes T cytotoxiques endogènes et exogènes, tout en limitant l'inhibition immunitaire intratumorale. Pour cela, nous développons des glycoprotéines d'enveloppe lentivirales oncotropes conçues pour reconnaître des antigènes de surface des cellules tumorales, et dont les capsides seront armées d'informations permettant la sécrétion tumorospécifique de chimiokines et la création de vulnérabilités immunitaires du microenvironnement tumoral.
La thérapie génique sera administrée par voie intraveineuse ou intratumorale chez des souris immunocompétentes porteuses de greffes tumorales syngéniques orthotopiques présentant des potentiels métastatiques et des intensités de réaction desmoplastique variables. Des tumeurs PDAC issues de lignées cellulaires humaines et de patients seront traitées dans des modèles in vitro 3D et des modèles précliniques. Les souris recevront des cellules CAR-T murines ou humaines spécifiques des tumeurs. Le volume tumoral sera évalué par imagerie de bioluminescence ou de fluorescence in vivo. Le paysage immunitaire tumoral sera caractérisé par cytométrie en flux et histologie, incluant l'analyse du recrutement des cellules CAR-T et des lymphocytes T endogènes ainsi que de leur état d'activation, en parallèle de l'évaluation de la cytotoxicité des cellules tumorales.
Bien que la thérapie génique offre aujourd'hui une médecine de précision dans les maladies non cancéreuses, atteindre chaque cellule par infection virale demeure hors de portée dans les applications oncologiques. Cibler seulement une fraction des cellules tumorales afin de générer des signaux diffus locaux permettant de rompre le microenvironnement tumoral et prépareant une niche favorable à l'action des cellules CAR-T est une idée nouvelle. La thérapie génique anticancéreuse offre ainsi la possibilité de personnaliser le sécrétome tumoral afin de créer des vulnérabilités intratumorales.

Le cancer du pancréas est considéré comme un problème majeur de santé publique, avec plus de 400 000 décès par an dans le monde (GLOBOCAN 2020). L'adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC) représente plus de 90 % des cancers pancréatiques et son incidence augmente au cours des dernières décennies. La survie globale à 5 ans est faible, inférieure à 10 %, malgré l'amélioration des options thérapeutiques et l'identification de biomarqueurs prédictifs. Les traitements actuellement disponibles échouent à modifier de manière significative la survie globale. Ainsi, le PDAC constitue actuellement le principal besoin médical non satisfait en oncologie.
Le microenvironnement tumoral pancréatique (TME) est abondant et fortement immunosuppresseur, comprenant une matrice extracellulaire (MEC) dense et des signaux pro-tumoraux qui favorisent la progression du cancer et constituent une barrière physique et biologique aux traitements. Les tumeurs PDAC sont peu immunogènes, avec une diminution de l'infiltration et de la reconnaissance des cellules T, une déplétion des cellules myéloïdes inflammatoires et un échappement adaptatif des cellules tumorales vis-à-vis de l'immunité (1).
Parmi les stratégies innovantes anticancéreuses, la thérapie cellulaire adoptive (ACT) utilisant des cellules T à récepteur antigénique chimérique (CAR-T) et les anticorps monoclonaux dirigés contre des points de contrôle immunitaires ont donné des résultats remarquables chez les patients atteints de tumeurs solides ou hématologiques réfractaires ou en rechute. Les CAR-T cells sont des lymphocytes T génétiquement modifiés exprimant un récepteur synthétique reconnaissant un antigène spécifique exprimé à la surface des cellules cancéreuses. Une fois réinjectées, les CAR-T cells reconnaissent et détruisent les cellules cancéreuses via leur cytotoxicité naturelle, ont un potentiel d'amplification clonale et possèdent une mémoire immunologique (2). Cependant, ces thérapies restent inefficaces dans les tumeurs solides, notamment dans le PDAC. Les CAR-T cells ne pénètrent pas dans les tumeurs, ou lorsqu'elles y parviennent, elles sont supprimées (4). Ainsi, l'environnement clinique des CAR-T dans le PDAC doit être amélioré.
Surmonter le microenvironnement dense et immunosuppresseur est une stratégie potentielle pour améliorer la survie des CAR-T, leur infiltration et leur persistance dans le PDAC. Plusieurs approches ont été proposées pour modifier le TME ou les CAR-T elles-mêmes.

Notre objectif est de développer une approche alternative et innovante visant à créer des vulnérabilités intratumorales par thérapie génique en modifiant le microenvironnement tumoral immunosuppresseur. Pour cela, nous envisageons la production locale de signaux chimiotactiques favorisant l'infiltration des lymphocytes T, la modulation de la matrice extracellulaire pour faciliter la pénétration cellulaire, la levée de l'inhibition des lymphocytes T cytotoxiques et la combinaison avec les CAR-T cells.

L'objectif du travail est de restaurer une immunité intratumorale du PDAC en manipulant son microenvironnement tumoral immunosuppresseur. Le projet est divisé en trois work packages. Le work package 1 est dédié à la production de lentivirus oncotropes et à la caractérisation de la meilleure glycoprotéine virale ingénierée permettant de cibler des antigènes de surface tumoraux. Le work package 2 vise à induire la production de chimiokines et d'enzymes de remodelage du microenvironnement tumoral (TME) par les cellules tumorales dans un microenvironnement tumoral modélisé, et à évaluer l'efficacité antitumorale de cette stratégie dans des modèles murins et humains en 3D. Le work package 3 met à l'épreuve cette stratégie dans des modèles murins utilisant des greffes syngéniques dérivées de lignées cellulaires ou du modèle KPC, fournissant des TMEs présentant différents degrés de réaction desmoplastique, ainsi que dans des modèles précliniques humains utilisant des xénogreffes sous-cutanées et orthotopiques.