Chercheur - H/F - 33

Structure Délégation Régionale Inserm Nouvelle-Aquitaine - UMR 1219 dirgigée par M. Thiebaut

L'équipe SISTM, dirigée par Mélanie Prague fait partie de l'Inserm U1219 Bordeaux Population Health Center (BPH).

https://www.bordeaux-population-health.center/the-teams/biostatistics/

Mission principale

La personne recrutée aura pour mission de participer à la construction de modèles mathématiques (basés sur des équations différentielles) de la réponse immunitaire induite par vaccination et à la dynamique virale après infection en aidant à intégrer les derniers résultats biologiques connus en virologie et en immunologie dans ce domaine.

Ce projet se déroulera dans le cadre du PEPR MIE Previx. Ce projet est structuré en six groupes de travail employant des approches quantitatives adaptées à la diversité des données générées dans le cadre d'une pandémie. L'objectif est de définir les contours microbiologiques, infectiologiques et épidémiologiques des futures menaces. Le projet développera des méthodes pour détecter, caractériser et modéliser en temps réel un nouveau pathogène dès les premières informations disponibles. Il traitera notamment l'analyse de données hétérogènes et l'usage de l'apprentissage automatique. Le consortium réunit neuf unités de recherche aux compétences interdisciplinaires. Il produira des connaissances utiles à la santé publique et contribuera à la formation d'une nouvelle génération de spécialistes capables d'anticiper la virose respiratoire X.

Dans le cadre de ce projet, le chercheur contractuel s'intégrera dans le workpackage intra-hote. Une première contribution sera d'investiguer des design d'essai préclinique innovants et optimaux en collaboration avec Jeremie Guedj et France Mentre de l'unité inserm IAME paris.

Un des enjeux sera le développement de designs optimaux pour obtenir des estimations fiables des paramètres viro-immunologiques dans les modèles expérimentaux chez le primate non humain. Ces modèles sont essentiels pour l'étude de la pathogénie virale et des stratégies thérapeutiques. L'estimation de ces paramètres reste toutefois difficile en raison de contraintes de ressources et de conception expérimentale. Le travail portera sur l'usage de simulations pour analyser l'impact de différentes doses d'inoculation et d'un...